Problem ma charakter odwrotny niż Ci się wydaje. Tzn. ów błąd powoduje, że muzyczki mono robione w standardowym CMC mają problem z poprawnym odtwarzaniem na Atari, na którym włączone jest stereo. Np. tak jest z oryginalną muzyką w Lasermanii, trzeba wyłączyć stereo, żeby muzyka tam grała poprawnie.

Twoje obawy są bezpodstawne: jak zaczniesz używać sobie CMC w wersji stereo, to będzie wszystko działało poprawnie w stereo.

Edit: a nie, sorry, po przeczytaniu jeszcze raz zorientowałem się, że właśnie o to pytałeś:-) No dobra, niech już ta powyższa informacja zostanie, może się komuś przyda...
W takim razie w odpowiedzi na Twoje pytanie: są wersje CMC, które mają to poprawione, ale nie używam CMC, więc nie powiem które to wersje, ktoś inny się musi wypowiedzieć.